710710268159211876343129324919627234165177244231235154ヤマトキソウ……………………………… 維管束植物 461ヤマトグサ………………………………… 維管束植物 508205ヤマトスナハキバチ……………………… 昆虫類ヤマトヌマエビ…………………………… 甲殻類ヤマトマダラバッタ……………………… 昆虫類ヤマトミクリ……………………………… 維管束植物 559224ヤマトモンシデムシ……………………… 昆虫類ヤマネ……………………………………… 哺乳類ヤマヒョウタンボク……………………… 維管束植物 536ヤマホオズキ……………………………… 維管束植物 589ヤマホロシ………………………………… 維管束植物 403ヤママメタニシ…………………………… 貝類284ヤリタナゴ………………………………… 汽水淡水魚類 92625ヤワラゼニゴケ…………………………… 蘚苔類ユ ユウシュンラン…………………………… 維管束植物 352ユウスゲ（キスゲ） ……………………… 維管束植物 364642ユキグニヤコウタケ（仮称） …………… 菌類ユキヤナギ………………………………… 維管束植物 489ユキワリイチゲ…………………………… 維管束植物 56419ユビナガコウモリ………………………… 哺乳類ヨ ヨウジウオ………………………………… 汽水淡水魚類 88ヨウラクラン……………………………… 維管束植物 460ヨコグラノキ……………………………… 維管束植物 381ヨコトネカイメン………………………… 淡水海綿類 306ヨコミゾドロムシ………………………… 昆虫類182ヨコヤマヒゲナガカミキリ……………… 昆虫類ヨコワサルオガセ………………………… 地衣類ヨシゴイ…………………………………… 鳥類ヨシダカワザンショウ…………………… 貝類ヨシノキシタバ…………………………… 昆虫類ヨスジキリガ……………………………… 昆虫類ヨタカ……………………………………… 鳥類ヨツボシカミキリ………………………… 昆虫類ヨツモンカメムシ………………………… 昆虫類ヨロイグサ………………………………… 維管束植物 427リ リュウキュウマメガキ…………………… 維管束植物 582リュウキンカ……………………………… 維管束植物 475リュウノヒゲモ…………………………… 維管束植物 450リンドウ…………………………………… 維管束植物 509ル ルイヨウボタン…………………………… 維管束植物 474120ルーミスシジミ…………………………… 昆虫類ルリクワガタ……………………………… 昆虫類ルリハダホソクロバ……………………… 昆虫類ルリヒラタムシ…………………………… 昆虫類ルリボシカミキリ………………………… 昆虫類ルリボシヤンマ…………………………… 昆虫類ルリヨシノボリ…………………………… 汽水淡水魚類 87レ レンゲツツジ……………………………… 維管束植物 584294ワ ワカサギ…………………………………… 汽水淡水魚類 85ワスレナグモ……………………………… クモガタ類 258ワタナベカレハ…………………………… 昆虫類245ワチガイソウ……………………………… 維管束植物 392レンズヒラマキ（クルマヒラマキ） …… 貝類
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